Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCARF1Q14162 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
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