Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNGB1Q14028 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
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