Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNTA1Q13424 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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