Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MKRN3Q13064 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
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