Protein–RNA interactions for Protein: Q12500

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9, yeastyeast

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVL9Q12500 RRM3YHR031C 2172 nt3.02□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 ASI3YNL008C 2031 nt3.02□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 SKO1YNL167C 1944 nt3.02□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 YDR193WYDR193W 399 nt3.02□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 YKL091CYKL091C 933 nt3.02□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 MRPL38YKL170W 417 nt3.02□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 ECM9YKR004C 1134 nt3.02□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt3.02□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 RPL23AYBL087C 414 nt3.02□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 YOL029CYOL029C 606 nt3.02□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 SGT1YOR057W 1188 nt3.02□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 SWD3YBR175W 948 nt3.02□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.02□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 PMR1YGL167C 2853 nt3.02□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 NDT80YHR124W 1884 nt3.01□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 VPS63YLR261C 327 nt3.01□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 SEC14YMR079W 915 nt3.01□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 YNL203CYNL203C 612 nt3.01□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 YNL235CYNL235C 432 nt3.01□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 YPL107WYPL107W 747 nt3.01□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 YPR170CYPR170C 336 nt3.01□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 TIM12YBR091C 330 nt3.01□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 YJL132WYJL132W 2253 nt3.01□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 DBP10YDL031W 2988 nt3.01□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 AVT2YEL064C 1443 nt3.01□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 MRS2YOR334W 1413 nt3.01□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 RGC1YPR115W 3252 nt3.01□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 YLR278CYLR278C 4026 nt3□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 MET5YJR137C 4329 nt3□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 TMA20YER007C-A 546 nt3□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 YGL159WYGL159W 1113 nt3□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 YIP5YGL161C 933 nt3□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 PRP38YGR075C 729 nt3□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 BUD21YOR078W 645 nt3□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 YBR051WYBR051W 351 nt3□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 ADY4YLR227C 1482 nt3□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 SHS1YDL225W 1656 nt3□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 YME2YMR302C 2553 nt3□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 YKL075CYKL075C 1353 nt3□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 STE6YKL209C 3873 nt2.99□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 ITC1YGL133W 3795 nt2.99□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 SRB4YER022W 2064 nt2.99□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 ATG13YPR185W 2217 nt2.99□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt2.99□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 RPL27AYHR010W 411 nt2.99□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.99□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 YAR069CYAR069C 294 nt2.99□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 IRC21YMR073C 606 nt2.99□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 MUD1YBR119W 897 nt2.99□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 UBP14YBR058C 2346 nt2.99□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 JJJ2YJL162C 1752 nt2.99□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 VHR1YIL056W 1923 nt2.99□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 ATP22YDR350C 2055 nt2.98□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 snR5snR5 204 nt2.98□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 MIX14YDR031W 366 nt2.98□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 PEX18YHR160C 852 nt2.98□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt2.98□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 SMA2YML066C 1110 nt2.98□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 MIX23YBL107C 591 nt2.98□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 YBR062CYBR062C 543 nt2.98□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 ILS1YBL076C 3219 nt2.98□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 UBX3YDL091C 1368 nt2.98□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 FLO1YAR050W 4614 nt2.97□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt2.97□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 DAD1YDR016C 285 nt2.97□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 MRH1YDR033W 963 nt2.97□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 BMH2YDR099W 822 nt2.97□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.97□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.97□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 YGR017WYGR017W 894 nt2.97□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 YJR087WYJR087W 351 nt2.97□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 SFT1YKL006C-A 294 nt2.97□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 MCR1YKL150W 909 nt2.97□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 RPL6AYML073C 531 nt2.97□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 RPS16AYMR143W 432 nt2.97□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 YMR254CYMR254C 309 nt2.97□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 YPR050CYPR050C 414 nt2.97□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 RIF1YBR275C 5751 nt2.97□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 MED1YPR070W 1701 nt2.96□□□□□ -1.93
AVL9Q12500 ERG11YHR007C 1593 nt2.96□□□□□ -1.94
AVL9Q12500 YDR338CYDR338C 2088 nt2.96□□□□□ -1.94
AVL9Q12500 MAL33YBR297W 1407 nt2.96□□□□□ -1.94
AVL9Q12500 TMA64YDR117C 1698 nt2.96□□□□□ -1.94
AVL9Q12500 YNL193WYNL193W 1677 nt2.96□□□□□ -1.94
AVL9Q12500 ARK1YNL020C 1917 nt2.96□□□□□ -1.94
AVL9Q12500 OCA6YDR067C 675 nt2.96□□□□□ -1.94
AVL9Q12500 HMF1YER057C 390 nt2.96□□□□□ -1.94
AVL9Q12500 RRT13YER066W 558 nt2.96□□□□□ -1.94
AVL9Q12500 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt2.96□□□□□ -1.94
AVL9Q12500 COG2YGR120C 789 nt2.96□□□□□ -1.94
AVL9Q12500 YHR213WYHR213W 597 nt2.96□□□□□ -1.94
AVL9Q12500 YIL082WYIL082W 873 nt2.96□□□□□ -1.94
AVL9Q12500 SRP21YKL122C 504 nt2.96□□□□□ -1.94
AVL9Q12500 TDA8YAL064C-A 381 nt2.96□□□□□ -1.94
AVL9Q12500 YAR062WYAR062W 597 nt2.96□□□□□ -1.94
AVL9Q12500 VMA6YLR447C 1038 nt2.96□□□□□ -1.94
AVL9Q12500 CSI1YMR025W 888 nt2.96□□□□□ -1.94
AVL9Q12500 YNL043CYNL043C 321 nt2.96□□□□□ -1.94
AVL9Q12500 NGL1YOL042W 1092 nt2.96□□□□□ -1.94
AVL9Q12500 YCK2YNL154C 1641 nt2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21 ms