Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

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Length 901 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 SAP185YJL098W 3177 nt2.24□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 SDC25YLL016W 3147 nt2.24□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 NOP12YOL041C 1380 nt2.24□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 SWR1YDR334W 4545 nt2.24□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 AEP1YMR064W 1557 nt2.24□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 YCR064CYCR064C 411 nt2.24□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 MEI4YER044C-A 1227 nt2.24□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 COG7YGL005C 840 nt2.24□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 YGR050CYGR050C 357 nt2.24□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 PET191YJR034W 327 nt2.24□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 GSP1YLR293C 660 nt2.24□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.24□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 YNL089CYNL089C 477 nt2.24□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 MSN1YOL116W 1149 nt2.24□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 UBP2YOR124C 3819 nt2.24□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 YRO2YBR054W 1035 nt2.24□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 YBR292CYBR292C 372 nt2.24□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 TAE2YPL009C 3117 nt2.24□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 YIL080WYIL080W 4722 nt2.24□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 SRB4YER022W 2064 nt2.24□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 YNL018CYNL018C 1839 nt2.24□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 IRA2YOL081W 9240 nt2.23□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 COG2YGR120C 789 nt2.23□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 YIL012WYIL012W 342 nt2.23□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.23□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 YLL044WYLL044W 447 nt2.23□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt2.23□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 ATG3YNR007C 933 nt2.23□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 IRC13YOR235W 315 nt2.23□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 snR191snR191 274 nt2.23□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 DSF2YBR007C 2211 nt2.23□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 YJL132WYJL132W 2253 nt2.22□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 SCD5YOR329C 2619 nt2.22□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 FUS1YCL027W 1539 nt2.22□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 SGS1YMR190C 4344 nt2.22□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 TIM9YEL020W-A 264 nt2.22□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.22□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 AYR1YIL124W 894 nt2.22□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 NYV1YLR093C 762 nt2.22□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 YLR169WYLR169W 354 nt2.22□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 RPC40YPR110C 1008 nt2.22□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 CSH1YBR161W 1131 nt2.22□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 YDR186CYDR186C 2634 nt2.22□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 PTP3YER075C 2787 nt2.22□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 SPP41YDR464W 4308 nt2.22□□□□□ -2.05
MSH5Q12175 HOS4YIL112W 3252 nt2.21□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 snR76snR76 109 nt2.21□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.21□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.21□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 YMR31YFR049W 372 nt2.21□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 RTS3YGR161C 792 nt2.21□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 RNR2YJL026W 1200 nt2.21□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 VPS25YJR102C 609 nt2.21□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt2.21□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 CTL1YMR180C 963 nt2.21□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 FUS2YMR232W 2034 nt2.21□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 YNL046WYNL046W 519 nt2.21□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 MRPL17YNL252C 846 nt2.21□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 NOP14YDL148C 2433 nt2.21□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 SCY1YGL083W 2415 nt2.21□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 ROY1YMR258C 1662 nt2.21□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 YEL1YBL060W 2064 nt2.21□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 ASI3YNL008C 2031 nt2.2□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 TOR1YJR066W 7413 nt2.2□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 TIF35YDR429C 825 nt2.2□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 LSM4YER112W 564 nt2.2□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 YFL015CYFL015C 495 nt2.2□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 YAL037WYAL037W 804 nt2.2□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 MRP49YKL167C 414 nt2.2□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 RMP1YLR145W 606 nt2.2□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 BAG7YOR134W 1230 nt2.2□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 HUA2YOR284W 732 nt2.2□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 YBP2YGL060W 1926 nt2.2□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 OSW7YFR039C 1533 nt2.2□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 YJL049WYJL049W 1353 nt2.2□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 ORC1YML065W 2745 nt2.19□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 YCT1YLL055W 1596 nt2.19□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 IPI3YNL182C 1668 nt2.19□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 YEL010WYEL010W 351 nt2.19□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 MVB12YGR206W 306 nt2.19□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.19□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 YJL032WYJL032W 315 nt2.19□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 YJL202CYJL202C 348 nt2.19□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 FAR3YMR052W 615 nt2.19□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 IRC21YMR073C 606 nt2.19□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 RPL36AYMR194W 303 nt2.19□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 YOL107WYOL107W 1029 nt2.19□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 YOR050CYOR050C 348 nt2.19□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 KSP1YHR082C 3090 nt2.19□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 PUF4YGL014W 2667 nt2.19□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 PHO91YNR013C 2685 nt2.19□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 MAL33YBR297W 1407 nt2.18□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 AFI1YOR129C 2682 nt2.18□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 YRR1YOR162C 2433 nt2.18□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 PIG2YIL045W 1617 nt2.18□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 MIG2YGL209W 1149 nt2.18□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 HTD2YHR067W 843 nt2.18□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 YKL131WYKL131W 522 nt2.18□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 FYV6YNL133C 522 nt2.18□□□□□ -2.06
MSH5Q12175 YAP7YOL028C 738 nt2.18□□□□□ -2.06
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