Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	YCR100C	YCR100C	951 nt		2.43	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	CPR5	YDR304C	678 nt		2.43	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	PEX4	YGR133W	552 nt		2.43	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	YHL044W	YHL044W	708 nt		2.43	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	YKL115C	YKL115C	393 nt		2.43	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	SRL3	YKR091W	741 nt		2.43	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	YLR012C	YLR012C	300 nt		2.43	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	RPL25	YOL127W	429 nt		2.43	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	HAT1	YPL001W	1125 nt		2.43	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	BTS1	YPL069C	1008 nt		2.43	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	TIM12	YBR091C	330 nt		2.43	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	NOP12	YOL041C	1380 nt		2.43	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	AYT1	YLL063C	1425 nt		2.42	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	YDR061W	YDR061W	1620 nt		2.42	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	ARP5	YNL059C	2268 nt		2.42	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	YIL080W	YIL080W	4722 nt		2.42	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	HSE1	YHL002W	1359 nt		2.42	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	MRP10	YDL045W-A	288 nt		2.42	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	YDR090C	YDR090C	933 nt		2.42	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	RSM24	YDR175C	960 nt		2.42	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	HTB1	YDR224C	396 nt		2.42	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	YFR054C	YFR054C	579 nt		2.42	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	MIG2	YGL209W	1149 nt		2.42	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	VMA7	YGR020C	357 nt		2.42	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	COX6	YHR051W	447 nt		2.42	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	YIL141W	YIL141W	390 nt		2.42	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	CTK2	YJL006C	972 nt		2.42	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	YJL169W	YJL169W	369 nt		2.42	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	APC9	YLR102C	798 nt		2.42	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	PEX17	YNL214W	600 nt		2.42	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	PEX27	YOR193W	1131 nt		2.42	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	RFC5	YBR087W	1065 nt		2.42	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	VMA9	YCL005W-A	222 nt		2.42	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	KAR4	YCL055W	1008 nt		2.42	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	PDR1	YGL013C	3207 nt		2.42	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	DSF2	YBR007C	2211 nt		2.42	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	YPK1	YKL126W	2043 nt		2.42	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	YDR133C	YDR133C	336 nt		2.41	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	YFR057W	YFR057W	456 nt		2.41	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	YGL159W	YGL159W	1113 nt		2.41	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	VEL1	YGL258W	621 nt		2.41	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	YAL066W	YAL066W	309 nt		2.41	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	ARC18	YLR370C	537 nt		2.41	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	ADI1	YMR009W	540 nt		2.41	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	PET20	YPL159C	762 nt		2.41	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	MSH4	YFL003C	2637 nt		2.4	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	HBT1	YDL223C	3141 nt		2.4	□□□□□ -2.02
VIK1	Q12045	ORC1	YML065W	2745 nt		2.4	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	CWC23	YGL128C	852 nt		2.4	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	YHL002C-A	YHL002C-A	489 nt		2.4	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	IKI1	YHR187W	930 nt		2.4	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	YKL033W-A	YKL033W-A	711 nt		2.4	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	RPS30A	YLR287C-A	192 nt		2.4	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	MER1	YNL210W	813 nt		2.4	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	YOR055W	YOR055W	435 nt		2.4	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	RPC40	YPR110C	1008 nt		2.4	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	YEF3	YLR249W	3135 nt		2.4	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	NEL1	YHR035W	1893 nt		2.39	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	UTP5	YDR398W	1932 nt		2.39	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	GCV2	YMR189W	3105 nt		2.39	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	YFH1	YDL120W	525 nt		2.39	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	ATC1	YDR184C	885 nt		2.39	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	YER046W-A	YER046W-A	330 nt		2.39	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	YJL032W	YJL032W	315 nt		2.39	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	YKL069W	YKL069W	543 nt		2.39	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	MCR1	YKL150W	909 nt		2.39	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	YKE2	YLR200W	345 nt		2.39	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	ILV5	YLR355C	1188 nt		2.39	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	YOL106W	YOL106W	354 nt		2.39	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	ARF3	YOR094W	552 nt		2.39	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	SFG1	YOR315W	1041 nt		2.39	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	DBF20	YPR111W	1695 nt		2.38	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	YOL057W	YOL057W	2136 nt		2.38	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	SRD1	YCR018C	666 nt		2.38	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	YRB1	YDR002W	606 nt		2.38	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	ERV1	YGR029W	570 nt		2.38	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	GTR2	YGR163W	1026 nt		2.38	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	MVB12	YGR206W	306 nt		2.38	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	KHA1	YJL094C	2622 nt		2.38	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	YAL031W-A	YAL031W-A	309 nt		2.38	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	GPX1	YKL026C	504 nt		2.38	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	DYN3	YMR299C	939 nt		2.38	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	YOR097C	YOR097C	528 nt		2.38	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	SWA2	YDR320C	2007 nt		2.37	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	YJL132W	YJL132W	2253 nt		2.37	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	YBT1	YLL048C	4986 nt		2.37	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	CDC123	YLR215C	1083 nt		2.37	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	YLR366W	YLR366W	306 nt		2.37	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	URB2	YJR041C	3525 nt		2.37	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	TPS2	YDR074W	2691 nt		2.36	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	PTP3	YER075C	2787 nt		2.36	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	HMO1	YDR174W	741 nt		2.36	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	COG2	YGR120C	789 nt		2.36	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	RPL8B	YLL045C	771 nt		2.36	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	YLR050C	YLR050C	486 nt		2.36	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	YNL089C	YNL089C	477 nt		2.36	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	COQ10	YOL008W	624 nt		2.36	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	MGE1	YOR232W	687 nt		2.36	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	CIN2	YPL241C	807 nt		2.36	□□□□□ -2.03
VIK1	Q12045	TOF1	YNL273W	3717 nt		2.36	□□□□□ -2.03

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