Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHRNEQ04844 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNEQ04844 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms