Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms