Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPCQ03188 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPCQ03188 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms