Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SUMO1P63165 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms