Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV3P56539 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV3P56539 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV3P56539 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV3P56539 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV3P56539 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV3P56539 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV3P56539 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV3P56539 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV3P56539 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV3P56539 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV3P56539 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV3P56539 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV3P56539 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV3P56539 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV3P56539 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV3P56539 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV3P56539 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV3P56539 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV3P56539 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV3P56539 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV3P56539 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAV3P56539 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAV3P56539 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CAV3P56539 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAV3P56539 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAV3P56539 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAV3P56539 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAV3P56539 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAV3P56539 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAV3P56539 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAV3P56539 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAV3P56539 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAV3P56539 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAV3P56539 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CAV3P56539 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAV3P56539 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAV3P56539 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAV3P56539 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAV3P56539 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAV3P56539 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAV3P56539 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAV3P56539 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAV3P56539 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CAV3P56539 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAV3P56539 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAV3P56539 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAV3P56539 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAV3P56539 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAV3P56539 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAV3P56539 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAV3P56539 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAV3P56539 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAV3P56539 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAV3P56539 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAV3P56539 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV3P56539 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV3P56539 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV3P56539 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV3P56539 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV3P56539 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV3P56539 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV3P56539 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV3P56539 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV3P56539 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV3P56539 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV3P56539 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV3P56539 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV3P56539 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV3P56539 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV3P56539 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV3P56539 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV3P56539 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV3P56539 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV3P56539 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV3P56539 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CAV3P56539 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV3P56539 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV3P56539 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV3P56539 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV3P56539 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV3P56539 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV3P56539 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV3P56539 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV3P56539 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV3P56539 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV3P56539 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV3P56539 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV3P56539 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV3P56539 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV3P56539 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV3P56539 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV3P56539 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV3P56539 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV3P56539 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV3P56539 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV3P56539 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV3P56539 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAV3P56539 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV3P56539 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms