Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCPP55072 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCPP55072 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCPP55072 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCPP55072 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCPP55072 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCPP55072 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCPP55072 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCPP55072 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCPP55072 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCPP55072 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCPP55072 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCPP55072 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCPP55072 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCPP55072 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCPP55072 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCPP55072 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCPP55072 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCPP55072 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCPP55072 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VCPP55072 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VCPP55072 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCPP55072 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCPP55072 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VCPP55072 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VCPP55072 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VCPP55072 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
VCPP55072 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCPP55072 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCPP55072 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCPP55072 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCPP55072 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCPP55072 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VCPP55072 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCPP55072 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCPP55072 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCPP55072 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCPP55072 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCPP55072 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCPP55072 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCPP55072 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCPP55072 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCPP55072 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCPP55072 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCPP55072 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCPP55072 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCPP55072 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCPP55072 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCPP55072 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCPP55072 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCPP55072 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCPP55072 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCPP55072 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCPP55072 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCPP55072 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCPP55072 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VCPP55072 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCPP55072 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCPP55072 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCPP55072 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCPP55072 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VCPP55072 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCPP55072 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCPP55072 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VCPP55072 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCPP55072 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VCPP55072 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCPP55072 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCPP55072 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCPP55072 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCPP55072 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCPP55072 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCPP55072 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VCPP55072 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VCPP55072 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCPP55072 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCPP55072 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCPP55072 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCPP55072 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCPP55072 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCPP55072 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCPP55072 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCPP55072 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCPP55072 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCPP55072 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCPP55072 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCPP55072 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCPP55072 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VCPP55072 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCPP55072 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCPP55072 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCPP55072 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCPP55072 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCPP55072 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCPP55072 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VCPP55072 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCPP55072 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCPP55072 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCPP55072 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCPP55072 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms