Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOSBP53539 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOSBP53539 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOSBP53539 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOSBP53539 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FOSBP53539 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOSBP53539 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOSBP53539 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOSBP53539 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOSBP53539 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOSBP53539 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOSBP53539 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOSBP53539 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOSBP53539 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOSBP53539 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOSBP53539 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FOSBP53539 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOSBP53539 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOSBP53539 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOSBP53539 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOSBP53539 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOSBP53539 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOSBP53539 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOSBP53539 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOSBP53539 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOSBP53539 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOSBP53539 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOSBP53539 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOSBP53539 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOSBP53539 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOSBP53539 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOSBP53539 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOSBP53539 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOSBP53539 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOSBP53539 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOSBP53539 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOSBP53539 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOSBP53539 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOSBP53539 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FOSBP53539 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOSBP53539 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOSBP53539 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOSBP53539 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOSBP53539 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FOSBP53539 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FOSBP53539 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOSBP53539 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOSBP53539 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOSBP53539 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOSBP53539 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOSBP53539 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOSBP53539 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOSBP53539 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOSBP53539 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOSBP53539 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOSBP53539 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOSBP53539 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOSBP53539 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOSBP53539 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOSBP53539 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOSBP53539 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FOSBP53539 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOSBP53539 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOSBP53539 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOSBP53539 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOSBP53539 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOSBP53539 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOSBP53539 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOSBP53539 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOSBP53539 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOSBP53539 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOSBP53539 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOSBP53539 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOSBP53539 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOSBP53539 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOSBP53539 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOSBP53539 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOSBP53539 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOSBP53539 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOSBP53539 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOSBP53539 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOSBP53539 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOSBP53539 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOSBP53539 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOSBP53539 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOSBP53539 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOSBP53539 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOSBP53539 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOSBP53539 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOSBP53539 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOSBP53539 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FOSBP53539 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOSBP53539 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOSBP53539 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOSBP53539 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOSBP53539 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOSBP53539 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOSBP53539 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOSBP53539 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOSBP53539 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms