Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD12P35452 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD12P35452 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD12P35452 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD12P35452 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD12P35452 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD12P35452 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD12P35452 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD12P35452 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD12P35452 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD12P35452 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD12P35452 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD12P35452 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD12P35452 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD12P35452 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD12P35452 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD12P35452 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD12P35452 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD12P35452 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD12P35452 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXD12P35452 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD12P35452 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD12P35452 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD12P35452 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD12P35452 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD12P35452 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD12P35452 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD12P35452 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD12P35452 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD12P35452 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD12P35452 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD12P35452 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXD12P35452 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms