Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKARP32238 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKARP32238 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKARP32238 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKARP32238 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKARP32238 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKARP32238 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKARP32238 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKARP32238 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCKARP32238 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKARP32238 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKARP32238 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKARP32238 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKARP32238 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKARP32238 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKARP32238 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKARP32238 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKARP32238 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKARP32238 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKARP32238 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKARP32238 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKARP32238 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKARP32238 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCKARP32238 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCKARP32238 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKARP32238 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKARP32238 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKARP32238 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKARP32238 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKARP32238 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKARP32238 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKARP32238 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKARP32238 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKARP32238 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKARP32238 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKARP32238 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKARP32238 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKARP32238 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKARP32238 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKARP32238 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKARP32238 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKARP32238 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKARP32238 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKARP32238 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKARP32238 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKARP32238 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKARP32238 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKARP32238 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKARP32238 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKARP32238 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKARP32238 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKARP32238 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKARP32238 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKARP32238 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKARP32238 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKARP32238 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKARP32238 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKARP32238 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKARP32238 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKARP32238 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKARP32238 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKARP32238 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKARP32238 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKARP32238 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKARP32238 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKARP32238 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKARP32238 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKARP32238 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms