Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTGFP29279 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CTGFP29279 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTGFP29279 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTGFP29279 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTGFP29279 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CTGFP29279 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTGFP29279 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTGFP29279 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTGFP29279 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTGFP29279 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTGFP29279 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTGFP29279 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTGFP29279 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CTGFP29279 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTGFP29279 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTGFP29279 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTGFP29279 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTGFP29279 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTGFP29279 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTGFP29279 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTGFP29279 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTGFP29279 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTGFP29279 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTGFP29279 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTGFP29279 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTGFP29279 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTGFP29279 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTGFP29279 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTGFP29279 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CTGFP29279 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTGFP29279 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CTGFP29279 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTGFP29279 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTGFP29279 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTGFP29279 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTGFP29279 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTGFP29279 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTGFP29279 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CTGFP29279 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CTGFP29279 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTGFP29279 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTGFP29279 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTGFP29279 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTGFP29279 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTGFP29279 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTGFP29279 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTGFP29279 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTGFP29279 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTGFP29279 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTGFP29279 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTGFP29279 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTGFP29279 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTGFP29279 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTGFP29279 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTGFP29279 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTGFP29279 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTGFP29279 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTGFP29279 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CTGFP29279 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTGFP29279 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTGFP29279 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTGFP29279 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CTGFP29279 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTGFP29279 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTGFP29279 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTGFP29279 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTGFP29279 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTGFP29279 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTGFP29279 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTGFP29279 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTGFP29279 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTGFP29279 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTGFP29279 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTGFP29279 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTGFP29279 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTGFP29279 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTGFP29279 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTGFP29279 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTGFP29279 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTGFP29279 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTGFP29279 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTGFP29279 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTGFP29279 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTGFP29279 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTGFP29279 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTGFP29279 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTGFP29279 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTGFP29279 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTGFP29279 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTGFP29279 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTGFP29279 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTGFP29279 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTGFP29279 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTGFP29279 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTGFP29279 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTGFP29279 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTGFP29279 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTGFP29279 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTGFP29279 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms