Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFKBIAP25963 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFKBIAP25963 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms