Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASTP20810 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASTP20810 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASTP20810 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASTP20810 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASTP20810 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASTP20810 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASTP20810 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASTP20810 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASTP20810 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASTP20810 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASTP20810 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CASTP20810 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASTP20810 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASTP20810 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASTP20810 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASTP20810 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CASTP20810 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASTP20810 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASTP20810 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CASTP20810 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASTP20810 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASTP20810 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASTP20810 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASTP20810 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASTP20810 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASTP20810 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASTP20810 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASTP20810 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CASTP20810 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASTP20810 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASTP20810 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASTP20810 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASTP20810 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASTP20810 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASTP20810 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASTP20810 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASTP20810 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASTP20810 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASTP20810 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASTP20810 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASTP20810 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CASTP20810 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASTP20810 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASTP20810 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASTP20810 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASTP20810 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASTP20810 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASTP20810 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASTP20810 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASTP20810 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASTP20810 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASTP20810 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASTP20810 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASTP20810 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CASTP20810 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASTP20810 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASTP20810 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASTP20810 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CASTP20810 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASTP20810 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASTP20810 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASTP20810 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASTP20810 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASTP20810 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASTP20810 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASTP20810 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASTP20810 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASTP20810 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASTP20810 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASTP20810 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASTP20810 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASTP20810 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASTP20810 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CASTP20810 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASTP20810 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CASTP20810 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASTP20810 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASTP20810 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASTP20810 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASTP20810 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASTP20810 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASTP20810 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASTP20810 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASTP20810 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASTP20810 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASTP20810 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASTP20810 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASTP20810 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASTP20810 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASTP20810 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASTP20810 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASTP20810 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASTP20810 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASTP20810 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASTP20810 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASTP20810 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASTP20810 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASTP20810 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASTP20810 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms