Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC3P19447 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC3P19447 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms