Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TIMP1P01033 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMP1P01033 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms