Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZBED1O96006 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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