Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRIG2O94898 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIG2O94898 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms