Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSO75390 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSO75390 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSO75390 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSO75390 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSO75390 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSO75390 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSO75390 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSO75390 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSO75390 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSO75390 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSO75390 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSO75390 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSO75390 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CSO75390 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSO75390 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSO75390 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSO75390 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSO75390 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSO75390 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSO75390 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSO75390 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSO75390 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSO75390 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSO75390 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSO75390 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSO75390 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSO75390 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSO75390 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CSO75390 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSO75390 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSO75390 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSO75390 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSO75390 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSO75390 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSO75390 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSO75390 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSO75390 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSO75390 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSO75390 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSO75390 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSO75390 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSO75390 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSO75390 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSO75390 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSO75390 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSO75390 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSO75390 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSO75390 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSO75390 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSO75390 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSO75390 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSO75390 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CSO75390 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSO75390 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSO75390 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSO75390 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSO75390 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSO75390 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSO75390 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSO75390 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSO75390 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSO75390 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSO75390 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSO75390 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSO75390 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSO75390 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSO75390 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CSO75390 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSO75390 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSO75390 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSO75390 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSO75390 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSO75390 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSO75390 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSO75390 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSO75390 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSO75390 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSO75390 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSO75390 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSO75390 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSO75390 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSO75390 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSO75390 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSO75390 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSO75390 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSO75390 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSO75390 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSO75390 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSO75390 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSO75390 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSO75390 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CSO75390 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSO75390 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSO75390 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSO75390 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSO75390 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSO75390 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CSO75390 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSO75390 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms