Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KIAA0556O60303 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KIAA0556O60303 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms