Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMD3O43242 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMD3O43242 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms