Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD8-MDP1E9PL57 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD8-MDP1E9PL57 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms