Protein–RNA interactions for Protein: E5RI56

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E5RI56 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E5RI56 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E5RI56 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E5RI56 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E5RI56 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E5RI56 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E5RI56 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E5RI56 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E5RI56 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
E5RI56 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E5RI56 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
E5RI56 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
E5RI56 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
E5RI56 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
E5RI56 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
E5RI56 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E5RI56 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
E5RI56 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E5RI56 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E5RI56 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E5RI56 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E5RI56 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E5RI56 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E5RI56 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E5RI56 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E5RI56 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E5RI56 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E5RI56 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E5RI56 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
E5RI56 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E5RI56 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E5RI56 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E5RI56 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E5RI56 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E5RI56 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E5RI56 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E5RI56 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E5RI56 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E5RI56 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E5RI56 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E5RI56 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E5RI56 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E5RI56 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E5RI56 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E5RI56 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E5RI56 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E5RI56 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E5RI56 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E5RI56 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E5RI56 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E5RI56 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E5RI56 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E5RI56 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E5RI56 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E5RI56 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E5RI56 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E5RI56 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E5RI56 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E5RI56 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E5RI56 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E5RI56 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E5RI56 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E5RI56 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E5RI56 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E5RI56 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E5RI56 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E5RI56 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E5RI56 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E5RI56 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E5RI56 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
E5RI56 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E5RI56 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E5RI56 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
E5RI56 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E5RI56 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E5RI56 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E5RI56 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
E5RI56 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E5RI56 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
E5RI56 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E5RI56 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E5RI56 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E5RI56 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E5RI56 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E5RI56 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E5RI56 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E5RI56 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
E5RI56 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
E5RI56 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E5RI56 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E5RI56 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E5RI56 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E5RI56 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
E5RI56 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
E5RI56 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E5RI56 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E5RI56 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
E5RI56 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
E5RI56 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
E5RI56 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms