Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms