Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHKBQ9Y259 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CHKBQ9Y259 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms