Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MRTO4Q9UKD2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MRTO4Q9UKD2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms