Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH22Q9UJ99 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH22Q9UJ99 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms