Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGXB4Q9UGU5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms