Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PEF1Q9UBV8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms