Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK12Q9NYV4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK12Q9NYV4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms