Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST12Q9NRB3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms