Protein–RNA interactions for Protein: Q9H300

PARL, Presenilins-associated rhomboid-like protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARLQ9H300 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PARLQ9H300 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms