Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDCBP2Q9H190 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms