Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCSER1Q9C0I3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms