Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LNPKQ9C0E8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LNPKQ9C0E8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LNPKQ9C0E8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LNPKQ9C0E8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LNPKQ9C0E8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LNPKQ9C0E8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LNPKQ9C0E8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LNPKQ9C0E8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LNPKQ9C0E8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LNPKQ9C0E8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LNPKQ9C0E8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LNPKQ9C0E8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LNPKQ9C0E8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LNPKQ9C0E8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LNPKQ9C0E8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LNPKQ9C0E8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LNPKQ9C0E8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LNPKQ9C0E8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LNPKQ9C0E8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LNPKQ9C0E8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LNPKQ9C0E8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms