Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC13A1Q9BZW2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC13A1Q9BZW2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC13A1Q9BZW2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC13A1Q9BZW2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC13A1Q9BZW2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC13A1Q9BZW2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC13A1Q9BZW2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC13A1Q9BZW2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC13A1Q9BZW2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC13A1Q9BZW2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC13A1Q9BZW2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC13A1Q9BZW2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC13A1Q9BZW2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms