Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAAF1Q9BRP4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAAF1Q9BRP4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms