Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TM2D3Q9BRN9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms