Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC38A2Q96QD8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC38A2Q96QD8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms