Protein–RNA interactions for Protein: Q96NS8

CLUHP3, Putative protein CLUHP3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUHP3Q96NS8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLUHP3Q96NS8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms