Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCLT1Q96NL6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms