Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms