Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC12Q96J65 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC12Q96J65 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC12Q96J65 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC12Q96J65 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC12Q96J65 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC12Q96J65 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC12Q96J65 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC12Q96J65 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC12Q96J65 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC12Q96J65 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC12Q96J65 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC12Q96J65 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC12Q96J65 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC12Q96J65 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC12Q96J65 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC12Q96J65 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC12Q96J65 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC12Q96J65 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC12Q96J65 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms