Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC10A4Q96EP9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC10A4Q96EP9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms