Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MALSU1Q96EH3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MALSU1Q96EH3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms